Структура управления образовательной организации четырехуровневая.
1) Первый уровень - директор - главное административное лицо, воплощающее единоначалие и несущее персональную ответственность за все, что делается в образовательном учреждении всеми субъектами управления. На этом же уровне модели находятся высшие органы коллегиального и общественного управления. Субъекты управления этого уровня обеспечивает единство управляющей системы в целом, определяют стратегическое направление развития образовательного учреждения, всех его подразделений.
 2) Второй уровень - заместители директора образовательного учреждения, органы, входящие в сферу влияния каждого из членов администрации. Каждый член администрации курирует определенное направление или подразделение учебно-воспитательной системы. Этот уровень выступает звеном опосредованного руководства директора образовательной системой. Его главная функция согласование деятельности всех участников процесса в соответствии с заданными целями, программой и ожидаемыми результатами, то есть добиваться тактического воплощения стратегических задач и прогнозов.
3) Третий уровень - методические объединения. К управленцам этого уровня относятся руководители методических объединений. Взаимодействие субъектов управления этого уровня осуществляется через специализацию функций при их одновременной интеграции. Руководство на этом уровне основано преимущественно на личных контактах, осуществляется с учетом индивидуальных особенностей и не формализовано.
4) Четвертый уровень - учащиеся, родители и учителя. Развитие самоуправления на этом уровне обеспечивает реализацию принципа демократизации. Участие детей в управляющей системе формирует их организаторские способности и деловые качества.
Коллегиальные органы управления:
 1) Общее собрание работников ОУ
 2) Педагогический совет
 3) Управляющий совет

В состав Муниципального бюджетного общеобразовательного учреждения - Шатиловский лицей входит один филиал - Косарёвский.

Положения о филиалах МБОУ-Шатиловской лицей

• Косарёвский филиал

     Косаревский филиал Муниципального бюджетного общеобразовательного учреждения - Шатиловский лицей; Сокращенно - Косаревский филиал МБОУ - Шатиловский лицей.

Место нахождения филиала: 303622, Орловская область, Новодеревеньковский район, с. Косарево.